Lãnh đạo Sở:
- Giám đốc Sở Bùi Duy Cường
- Phó Giám đốc Nguyễn Minh Tấn
- Phó Giám đốc Tạ Văn Tường
- Phó Giám đốc Vũ Xuân Tùng
- Phó Giám đốc Nguyễn Mạnh Phương
- Phó Giám đốc Nguyễn Đình Hoa
Các phòng :
- Phòng Kiểm tra Nông nghiệp và Môi trường
- Phòng Chính sách Nông nghiệp và Môi trường
- Phòng Quy hoạch - Kế hoạch sử dụng đất
- Phòng Chất lượng và Phát triển thị trường
- Phòng Phát triển nông thôn
- Phòng Thống kê đất đai và Đo đạc bản đồ
- Phòng Quản lý chất thải rắn
- Phòng Khoáng sản và Tài nguyên nước
Đơn vị Sự nghiệp
- Chi cục Thủy lợi và Phòng, chống thiên tai
- Chi cục Chăn nuôi, Thủy sản và Thú y
- Chi cục Trồng trọt và Bảo vệ thực vật
- Trung tâm Khuyến nông Hà Nội
- Văn phòng Đăng ký đất đai Hà Nội
- Trung tâm Cứu hộ động vật hoang dã Hà Nội
- Trung tâm Phát triển quỹ đất Hà Nội
- Trung tâm Kỹ thuật Nông nghiệp và Môi trường Hà Nội
- Trung tâm Công nghệ thông tin và Chuyển đổi số Nông nghiệp và Môi trường Hà Nội
